硬盘空间被谁占用了？

八成你的D盘和E盘是FAT32格式．
这里介绍一下簇
http://zhidao.baidu.com/question/1628648.html
你在某个盘里建个文本文档，随便输入个数字然后保存，右键查看大小显示大小1kb,占用空间多少KB那就是你这个盘的簇，也就是每个文件至少要占用的空间．估计你的电脑显示的是16KB，而你D盘又有大量的小文件，造成硬盘的浪费．

建议你将你的硬盘分成2类，一类格式是NTFS，一类是FAT32．这样把文件数量多而容量小的放NTFS里，比如很多软件，把大的文件放FAT32里，比如歌曲电影，这样能将你的硬盘利用率达到最大．

NTFS格式的硬盘单个文件不能超过4GB．

看看回收站是不是没清空

显示出全部的文件看一下，方法：打开我的电脑，点工具、文件夹选项、查看，把隐藏文件或文件夹下的选择显示所有文件或文件夹，就可以看到全部的文件了

有可能是部分东西被隐藏了。
一打开D或其他盘点文件夹选项，然后点查看，最后点显示隐藏的文件和文件夹就OK了！！！

隐藏文的文件。

你的电脑应该是开了系统还原服务吧。
一般情况下是看不到这个文件夹的，是隐藏的，就算显示隐藏文件也看不到。而且很多病毒都喜欢躲在这个文件夹里。
正常模式是删除不了的。
先把你的系统还原给关了，然后进安全模式删除
System Volume Information
删不掉就想办法吧。