蛋白质分子结构中R基上是否有N?

不一定啊
N可以位于R基的氨基或者含N杂环里面

R基通常表示氨基酸残基的侧链
碱性氨基酸如赖氨酸，精氨酸，脯氨酸和酰氨类氨基酸如天冬酰胺，谷氨酰胺都有N
而其他氨基酸没有

1每种氨基酸分子至少都含有一个氨基(--NH2)和一个羧基(--COOH)，还有一分子氢和一个特有的R基团，不同的氨基酸的R基因是不同的，也就是说R基的不同决定了氨基酸的种类不同。
它们都连在同一个碳原子上。此碳原子叫中心碳原子。
2.特有的R基是可能有N原子的。

可能有也可能没有。
R基一般指烃基

应该问氨基酸上的R基有没有N！

不一定。
可以有也可以没有。