做AFLP怎样选择限制性内切酶呀？

一般用两中限制性内切酶,一个是高频的,一个是低频的,分别用于控制片段的大小和数量,不同的种属其DNA序列的特征也大不相同,建议你去搜一下期刊,做番茄水稻AFLP的有很多,看看别人都用什么,另外,你应该去丁香园提问,那里更容易得到满意的答复

我们实验室做的是子表观遗传学。我前一段时间做的是水稻的甲基化情况，用的就是AFLP。选择的限制性内切酶是EcoR1和Hap11/Msp1(应该是罗马数字1和2，没敲出来)。EcoR1识别的位点比较多，而且是固定的。而Hap11/Msp1识别的是CCGG位点，而且不同的甲基化情况会有不同的活性（能不能切开），通过AFLP计带分析就可以研究基因组范围内的特定甲基化情况了。至于番茄我没有做过，所以就不能给出参考意见了！呵呵