更改离婚协议后民政局的备份作废吗

如果你没向民政局提交新的合同协议，那它就仍然是有效的。但是根据合同法，你后来更改过的协议显然具有更强的法律效力。

只要你的手续是合法没有什么违规的，那么备份就当然是作废的啦。
你要还有什么担心或顾虑的话可以到民政局注销一下就可以了。