公司法人格否定制度与市场经济体制要求市场主体独立是否矛盾？

两者是不矛盾的
市场主体的独立地位是为了在市场机制的运做中，明晰权利和义务的归属者，更好的落实市场主体的责任，市场主体地位制度是市场高效运转的必要条件．
而公司法中的人格否认制度是说在公司的股东，主要负责人员等在公司的运转过程中滥用股东权利或滥用公司的独立地位损害对方当事人利益的情况下，我们必须否认公司的独立性，揭开公司面纱，追究其背后股东等相关人员的责任