三级甲等医院的学科带头人（科主任）可以是初级职称的吗？

你的问题很有意思。首先我们来说几个关键词，
一、学科带头人：在某一领域中具有较高学术水平的，能带领大家一起在这一领域共同发展人。
二、初级职称：在某一学科中具有了相应技能的专业人员的一种技能评定结果。
这样一来，我想这个问题就清楚了。
说句笑话吧，一头小毛驴怎么可能领跑汽车呢？

主任不一定是学科带头人。也不一定要高级职称。但学科带头人一定是高级职称。