2005年我公司在新建厂房过程中所有的付款业务都没有做帐务处理，请问在2006年我该怎么进行帐务处理

你们的厂房现在投入使用了没有？付款的时候取得相关的发票了没有？
如果付款没有入帐，那么你们的银行对帐应该是不平的，是吗？

如果厂房还没有投入使用，那么
1、如果已经取得发票
借 在建工程
贷 银行存款
2、如果还没有取得发票
借 预付帐款
贷 银行存款
如果厂房已经投入使用，帐务处理会麻烦一些，无论是否已经取得发票，都要确认为固定资产
借 固定资产
贷 银行存款
同时，按照固定资产投入使用的时间，补提以前月份的折旧，涉及到去年应补提的折旧，要调整去年的利润。