为何法院判决我的《房屋所有权证》无效？

原被告双方是一所高校的职工，原告是退休教授，被告是在职干部。
2003年原告住新楼房，所以把誊出的旧房卖给被告，被告也承诺购买此套房屋。后来原告因事外出，由于原告与被告的买卖意思表示真实，在此期间校方管理房屋买卖的负责人填写了《房地产买卖契约》并且自己代写了原被告两人的签名，又至被告处加盖了被告本人的章子。去房管局办理过户手续时，被告却又画蛇添足地在双方签名处按了手印。当时原告购买学校新房的房款还欠着35000元，这位负责人就向已外出的原告打电话催交房款，原告在外地电话通知负责人以及被告：原告欠学校的余款由被告代交，作为首付定金。被告在房管局办理过户所需的《土地使用权证》由校方提供，原告旧房的《房屋所有权证》以及身份证由原告电话其养女交给被告。同一天，被告帮助原告在房管局办理了其新房的《房屋所有权证》（房款已由被告补齐），以及被告购买原告旧房的《房屋所有权证》（负责人写的那份《房地产买卖契约》已写明剩余款于2004年6月前补齐）；两份过户契税合计3800元也由被告交纳。
原告延迟了约定日期，直到2004年10月回到本地。此时被告找原告交付剩余房款，原告听说房屋正在涨价，便向被告索要高价。在此期间被告已将自己的原有住房卖给学校的其他同志，被告认为：合同订立的当时两套房屋的价值相当，所以就按照学校统一定价卖的。涨价是后来的事情，不应由被告来承担。原告当即毁约。后来学校又多次向双方做协调工作，原告不依不挠地主张新房价。事情就此拖沓直至2005年7月，被告亦无法完成和原告的交易，被告的住房虽然已经卖出，却也无法给交付给买方，因为那样将陷入无处可居的两难境地。被告无奈便接受了原告无理提出的价格，在负责人的代表下找到原告交钱。原告的想法很奇怪，拒绝写收据并且极端怀疑被告使用假钱，此时负责人提出办法，可以到银行把款存成一个帐号交给原告即可。被告照办之后，原告却又讹诈被告一万元现金交给其子女，并且依然拒绝写收据。被告肯定不答应，随后此事不甚了了。2005年9月某天，被告认为《房屋所有权证》是房屋所有权的唯一合法凭证，就在校领导的批准下将所属房屋的锁子撬开，有校保卫处做录象证明其中财物（原告已经搬至新楼，房屋几无所剩物品）。被告入住的当晚，原告偕同老伴及其子女趁被告不在家，前来滋事。将被告搬入的家当悉数从窗中扔出，吵闹打骂被告的家人。