开机后有咚咚的声音，响3次，屏幕上出来一个对话框“由于另一个程序正在应用，请切换到”是什么原因？

咚咚的声音你要仔细听是什么发出来的,根据个人观点,能发出这重类似声音的只有硬盘.不过好象没你说的那么夸张.
或则是你装的某杀毒监控软件发出的警报声音.那就表示你的机器中毒了.
屏幕上出来一个对话框“由于另一个程序正在应用，请切换到”从这里看来确实是中毒.请先进入安全模式下杀毒.注意更新杀毒软件.
如果是和别人共用一条网线,杀毒的时候请把网线拔出.

被控制了 重装吧。。